根据2017年6月19日六届海南省人民第87次常务会议修订通过新的《琼州海峡轮渡运输管理规定》海南省琼州海峡轮渡运输管理办公室负责琼州海峡轮渡运输的具体监督管理工作,履行下列职责:
一、负责贯彻实施有关法律、法规、规章;
二、协调处理琼州海峡轮渡运输中发生的矛盾纠纷;
三、组织编制、及时调整琼州海峡船舶班期,并组织实施;
四、提出加强琼州海峡轮渡运输市场秩序管理的措施、编制疏运应急预案,并组织实施;
五、负责实施涉及琼州海峡轮渡运输的相关行政处罚;
六、法律、法规和省政府规定的其他职责。